森田疗法与其他疗法不同的是，它不是以直接消除各种抑郁症状为主要目标，而是以打破被束缚状态、恢复身体社会功能为主要治疗目标，通过灵活地运用森田疗法的各种治疗方法（如作业疗法、运动疗法、日记疗法、综合治疗等）提高患者对症状、对那些已经无法改变的事实的受容性，放下这件无法改变的事。这样一来以往无法接受的症状和那些已经无法改变的事实作为条件刺激引起情绪反应的状态被切断，即产生条件反射抑制，切断了关注症状和那些已经无法改变的事实产生的精神交互作用，打破注意固着于抑郁情绪、躯体不适症状、无法接受也无法改变的事实上的状态，改善思想矛盾，使患者的精神能量由一直供应给对负性信息的关注和围绕死的恐怖的行动，转变为持续供应给围绕生的欲望所进行的有建设性意义的行动。这样一来生的欲望和围绕它的行动得到精神能量的支持而被激活、扩展，并从所进行的各种有意义的活动中获得成就感，同时死的恐怖的行动以及各种精神症状则失去精神能量的支持而失去动力。这样精神能量新的运行方向和新的行动的结果打破了患者的被束缚状态，逐渐降低被束缚程度。由于抑郁症的被束缚程度与躯体不适症状和抑郁的程度呈正相关，所以被束缚状态越降低那么相应的躯体不适症状、抑郁情绪就会越减轻，这就是森田疗法对抑郁症的治疗机制。